倒置生物显微镜配有长工作距离的聚光镜，长工作距离平场消色差物镜，故可使用各种培养皿和培养瓶对活体细胞和组织、流质、沉淀物等进行显微研究。倒置生物显微镜在细胞学、寄生虫学、肿瘤学、免疫学、遗传工程学、工业微生物学、植物学等领域中应用广泛。
倒置生物显微镜的构造主要分为三部分:机械部分、照明部分和光学部分。
一、机械部分
⑴镜座:是显微镜的底座，用以支持整个镜体。
⑵镜柱:是镜座上面直立的部分，用以连接镜座和镜臂。
⑶镜臂:一端连于镜柱，一端连于镜筒，是取放显微镜时手握部位。
⑷镜筒:连在镜臂的前上方，镜筒上端装有目镜，下端装有物镜转换器。
⑸物镜转换器(旋转器):接于棱镜壳的下方，可自由转动，盘上有3-4个圆孔，是安装物镜部位，转动转换器，可以调换不同倍数的物镜，当听到碰叩声时，方可进行观察，此时物镜光轴恰好对准通光孔中心，光路接通。
⑹镜台(载物台):在镜筒下方，形状有方、圆两种，用以放置玻片标本，中央有一通光孔，我们所用的显微镜其镜台上装有玻片标本推进器(推片器)，推进器左侧有弹簧夹，用以夹持玻片标本，镜台下有推进器调节轮，可使玻片标本作左右、前后方向的移动。
⑺调节器:是装在镜柱上的大小两种螺旋，调节时使镜台作上下方向的移动。
①粗调节器(粗螺旋):大螺旋称粗调节器，移动时可使镜台作快速和较大幅度的升降，所以能迅速调节物镜和标本之间的距离使物象呈现于视野中，通常在使用低倍镜时，先用粗调节器迅速找到物象。
②细调节器(细螺旋):小螺旋称细调节器，移动时可使镜台缓慢地升降，多在运用高倍镜时使用，从而得到更清晰的物象，并借以观察标本的不同层次和不同深度的结构。
二、照明部分
装在镜台下方，包括反光镜，集光器。
⑴反光镜:装在镜座上面，可向任意方向转动，它有平、凹两面，其作用是将光源光线反射到聚光器上，再经通光孔照明标本，凹面镜聚光作用强，适于光线较弱的时候使用，平面镜聚光作用弱，适于光线较强时使用。
⑵集光器(聚光器)位于镜台下方的集光器架上，由聚光镜和光圈组成，其作用是把光线集中到所要观察的标本上。
①聚光镜:由一片或数片透镜组成，起汇聚光线的作用，加强对标本的照明，并使光线射入物镜内，镜柱旁有一调节螺旋，转动它可升降聚光器，以调节视野中光亮度的强弱。
②光圈(虹彩光圈):在聚光镜下方，由十几张金属薄片组成，其外侧伸出一柄，推动它可调节其开孔的大小，以调节光量。
三、光学部分
⑴目镜:装在镜筒的上端，通常备有2-3个，上面刻有5×、10×或15×符号以表示其放大倍数，一般装的是10×的目镜。
⑵物镜:装在镜筒下端的旋转器上，一般有3-4个物镜，其中最短的刻有"10×"符号的为低倍镜，较长的刻有"40×"符号的为高倍镜，最长的刻有"100×"符号的为油镜，此外，在高倍镜和油镜上还常加有一圈不同颜色的线，以示区别。
